1、基本定义：化合物专利通常称为核心专利，其不包括以酸根、碱基、金属元素、结晶形式等结构改变实施保护的化合物专利，这类专利的特点是技术含量高、权利要求保护的范围宽、对真正目标化合物的隐蔽性强。
2、通式化合物：通式化合物，也称为基础化合物，该类化合物的专利仅指化合物核心结构的专利，往往我们将这类化合物专利也称为核心专利，通式化合物专利一旦获得授权，则是对化学物质或药物活性分子(API)的绝对保护，旁人难以规避，针对API的权利要求一般也很难被专利无效掉。
3、马库什化合物：大多数科研人员都知道通式化合物，但相信许多人可能没听说过马库什化合物，上世纪二十年代，尤金·马库什是第一个在美国专利申请中成功使用这种方法而获得权利要求的发明人，因此根据尤金·马库什(Markush的音译)而得名，而马库什化合物，就是指结构非常相似，性能或用途相同的通式化合物，这些化合物基于一定基础结构的前提下，具有一个或多个可变基团。
4、审查与撰写：对于马库什化合物专利申请来说，从诞生到现在己经90余年了，全世界各国都经历了相当长的审查实践，但是至今都没有一个国家对其制定出明确的标准，由于审查的严格，马库什化合物如何撰写就显得十分重要。
5、价值体现：从知识产权体系来说，化合物专利是创新药产品最为重要的知识产权；从开发过程来看，化合物专利是新药开发过程项目推进与投融资的重要筹码；从市场竞争来看，化合物专利是仿制药企业首先发起进攻的重点目标。
以下是两个与本文相关的问题及其解答：
1、问题一：为什么说化合物专利是药品的核心专利？
解答：因为药品的本质是化合物，化合物是所有药品的源头，并且由于化学药可以利用马库什方式的专利保护，生物药可以用药品本身的靶点或序列专利保护，能够保护化合物本身的一个或数个核心专利即可以对未来能够上市的药品及其整个链条进行控制。
2、问题二：马库什化合物的申请和审查有什么特点？
解答：马库什化合物的申请和审查有其特殊性，由于各国对马库什化合物的审查实践存在侧重，例如欧专局主要是控制其申请文件的修改，美国专利商标局主要是促进申请人公开充分，并通过严厉的惩罚来杜绝技术造假，日本特许厅主要关注支持性问题和修改超范围问题，中国专利局十分注重专利三性和支持性问题，马库什化合物的撰写也十分重要，需要考虑到说明书公开不充分、权利要求存在实用性、新颖性和创造性缺陷等问题。
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