根据《商标法》的规定，商标使用许可合同未备案的情况下，将受到以下处罚：
1、许可人或被许可人所在地的工商行政管理机关将责令限期改正；如果拒不改正，将面对一万元以下的罚款。
2、在持续不改正的情况下，工商行政管理机关可能会报请商标局撤销该注册商标。
| 序号 | 处罚措施 | 法律依据 |
| 1 | 责令限期改正 | 《商标法》第四十三条：商标使用许可合同未备案的，许可人或者被许可人所在地工商行政管理机关将责令限期改正 |
| 2 | 罚款：一万元以下 | 《商标法》第四十三条：拒不改正的，处以一万元以下的罚款 |
| 3 | 撤销注册商标 | 《商标法》第四十三条：拒不改正的，报请商标局撤销该注册商标 |
| 4 | 不能对抗善意第三人 | 《商标法》第四十三条：商标使用许可未经备案不得对抗善意第三人 |
请注意，这些处罚措施并非必然同时实施，具体处罚将根据实际情况和行政机关的判断来确定，若双方当事人履行了相关改正措施，如补办备案手续，可能会减轻或免除处罚。
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