保健品商标注册应遵循《中华人民共和国食品安全法》及相关的管理办法。
1、适用范围：本指南适用于使用保健食品原料目录以外原料的保健食品和首次进口的保健食品（不包括补充维生素、矿物质等营养物质的保健食品）注册申请。
2、申请材料形式要求：注册申请人应通过国家食品药品监督管理总局网站提交相关申请材料。
3、保健食品命名：为保证保健食品命名科学、规范，维护消费者合法权益，市场监管总局发布了《保健食品命名指南（2019年版）》，国家食品药品监督管理局还修订了《保健食品命名规定》。
4、注册申请人：国产保健食品注册申请人应当是在中国境内登记的法人或者其他组织；进口保健食品注册申请人应当是上市保健食品的境外生产厂商，申请进口保健食品注册的，应当由其常驻中国代表机构或者由其委托中国境内的代理机构办理。
5、审评与备案：保健食品注册是指食品药品监督管理部门根据注册申请人申请，对申请注册的保健食品的安全性、保健功能和质量可控性等相关申请材料进行系统评价和审评，并决定是否准予其注册的审批过程，而保健食品备案则是保健食品生产企业将表明产品安全性、保健功能和质量可控性的材料提交给食品药品监督管理部门进行存档、公开、备查的过程。
保健品商标注册不仅需要满足法律法规的基本要求，还要确保产品的命名科学、规范，同时要考虑到申请人的身份和资格，在整个过程中，应遵循科学、公开、公正、便民、高效的原则。
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