商标侵权查扣的依据主要分为两部分，一部分是法律规定，另一部分是国家知识产权局制定的《商标侵权判断标准》。
根据《中华人民共和国商标法》第六十二条和国家知识产权局的相关规定，当县级以上工商行政管理部门根据已经取得的违法嫌疑证据或者举报，对涉嫌侵犯他人注册商标专用权的行为进行查处时，可以行使以下职权：
1、询问有关当事人，调查与侵犯他人注册商标专用权有关的情况；
2、查阅、复制当事人与侵权活动有关的合同、发票、账簿以及其他有关资料；
3、对当事人涉嫌从事侵犯他人注册商标专用权活动的场所实施现场检查；
4、检查与侵权活动有关的物品；对有证据证明是侵犯他人注册商标专用权的物品，可以查封或者扣押。
判断是否构成商标侵权还需要判断涉嫌侵权行为是否构成商标法意义上的商标的使用，商标的使用是指将商标用于商品、商品包装、容器、服务场所以及交易文书上，或者将商标用于广告宣传、展览以及其他商业活动中，用以识别商品或者服务来源的行为。
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