商标权人在转让商标的过程中，如果发生商标侵权案件，可以继续进行诉讼，这是因为商标权的转让并不影响相关方对商标侵权案件的诉讼权利，换句话说，商标权人可以在转让商标的同时，针对涉及自己商标的侵权行为进行诉讼。
需要注意的是，在一些特殊情况下，如国家知识产权局核准了涉案商标的转让后，原商标侵权诉讼的处理方式可能会有所不同，在注册商标专用权被侵害的情况下，根据不同类型许可合同的规定，独占使用许可合同的被许可人和排他使用许可合同的被许可人可以选择向人民法院提起诉讼或与商标注册人共同起诉。
如果您正面临商标侵权官司的问题，建议您咨询专业律师以获取详细的法律建议和指导。
| 序号 | 转让阶段 | 是否可以发起商标侵权官司 | 法律依据/解释 |
| 1 | 转让手续办理中 | 可以 | 即使商标处于转让过程中，原商标注册人仍拥有商标专用权，因此可以发起侵权官司。 |
| 2 | 转让公告期内 | 可以 | 商标转让公告期内，原商标注册人仍拥有商标专用权，可以在此期间发起侵权官司。 |
| 3 | 转让完成后 | 受限制 | 商标转让完成后，原商标注册人不再拥有商标专用权，不能以原注册人身份发起侵权官司，受让人成为新的商标权人，有权发起侵权官司。 |
| 4 | 商标侵权行为发生 | 可以 | 商标侵权行为发生时，无论处于转让的哪个阶段，商标权人（原注册人或受让人）均有权发起侵权官司。 |
需要注意的是，在商标转让过程中，若涉及侵权行为，双方应充分沟通，明确责任，并根据实际情况采取相应措施，在商标转让完成后，原商标注册人若继续使用该商标，可能构成侵权行为，此时受让人可以发起侵权官司。
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