处理市场监管部门商标侵权纠纷，首先需要判断是否构成商标侵权，根据《中华人民共和国商标法》和相关法律法规，一般需要判断涉嫌侵权行为是否构成商标法意义上的商标的使用，商标的使用是指将商标用于商品、商品包装、容器、服务场所以及交易文书上，或者将商标用于广告宣传、展览以及其他商业活动中，用以识别商品或者服务来源的行为。
处理步骤如下：
1、协商解决：当事人可以首先尝试通过协商来解决纠纷，如果协商无果，可以考虑进一步的法律途径。
2、向行政主管部门投诉：商标注册人或利害关系人可以向市场监督管理部门或其他具有商标行政执法权的相关部门投诉，工商行政管理部门有权认定侵权行为，并采取执法措施责令停止侵权行为。
3、提起诉讼：如果上述方法都不能解决问题，商标注册人或利害关系人可以向法院提起诉讼。
为加强知识产权执法工作，市场监管部门会定期进行执法检查，严厉打击侵犯商标、专利、地理标志等知识产权的违法行为，为了提高专利侵权纠纷行政裁决工作的效率与水平，有关部门还制定了《专利侵权纠纷行政裁决办案指南》，为企业和个人提供了明确的操作指引。
面对商标侵权纠纷，当事人应积极维护自己的合法权益，同时也可以寻求专业律师的帮助，确保自己的权益得到最大程度的保护。
| 序号 | 程序 | 具体操作 | 目的/效果 |
| 1 | 接到投诉或线索 | 市场监管部门接收来自权利人或其他方面的侵权投诉或线索 | 发现并确认侵权行为 |
| 2 | 立案调查 | 对涉嫌侵权的企业或个人进行立案调查，收集证据，确认侵权事实 | 查明侵权行为，为后续处理提供依据 |
| 3 | 行政调解 | 组织双方当事人进行调解，协商解决侵权问题 | 快速解决纠纷，降低双方成本，维护市场秩序 |
| 4 | 行政调解仲裁 | 若双方在行政调解过程中无法达成一致，可申请行政调解仲裁 | 强化调解协议的法律效力，保障双方权益 |
| 5 | 司法确认 | 将行政调解协议提交给法院进行司法确认，使之具有司法强制力 | 进一步保障双方权益，确保调解结果得以执行 |
| 6 | 处罚措施 | 对侵权行为采取以下一项或多项处罚措施：责令停止侵权、没收侵权商品、销毁侵权标识、罚款等 | 震慑侵权行为，保护知识产权，维护市场公平竞争 |
| 7 | 信用惩戒 | 将侵权行为纳入严重违法失信名单，通过国家企业信用信息公示系统公示 | 加大侵权成本，提高企业诚信意识，预防侵权行为再次发生 |
| 8 | 诉前化解 | 在案件进入诉讼程序前，积极采取多元化解措施，促使双方达成和解 | 降低诉讼成本，快速解决纠纷，减轻法院负担 |
| 9 | 诉讼程序 | 若双方无法在诉前化解，将进入正式诉讼程序，由法院审理判决 | 通过司法程序解决纠纷，维护双方合法权益 |
| 10 | 赔偿与执行 | 根据法院判决或调解结果，侵权方需赔偿权利人损失，并执行相关处罚措施 | 赔偿权利人损失，执行处罚，维护知识产权和市场秩序 |
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